Привет, Metalmih.
Всё правильно ты делаешь. Электро гитару, напрямую - обязательно подключать только в линейный вход. А так же бас гитару.

А что бы развеять вопросы нужно понять в чем разница, между Line In и Mic In. (скоро отпишусь)