Записывать нужно на той же частоте что и конечный результат. Любое пребразование частоты портит звук.
Разрядность записи лучше конечно 24 бита, чтобы динамический диапазон был ширее, а вот для сведения ваще по барабану 24 или 16, разницы я не понял.