Есть два распространённых способа - Phase Shift (сдвиг фазы) или Time Delay (сдвиг по времени). Есть различные плагины которые помогут сделать это.

Есть ещё один случай. Это когда один источник звука конфликтует с другими источниками, но на разных частотах. К примеру используя вышеперечисленные способы, получается достигнуть лишь хорошее звучание низких частот инструмента, либо высоких (которые конфликтуют уже с другим инструментом).
Первый способ - постараться поправить фазовый конфликт, в перечисленных конфликтующих инструментах. Либо разделить инструмент на два, создавая кроссовер (например LP, HP фильтрами) и корректрировать фазу для отдельного частотного диапазона.

Отслеживать это всё на слух, или же по аналайзерам. Работать как с отдельными инструментами, так и с группами, переодически прослушивая общее звучание всего проекта.