Зачем всё усложнять. Изначально подходи к работе правильно, во первых для того, что бы было удобно.
И выбери что то одно либо FL Studio либо Cubase. Некоторые плагины FL Studio доступны отдельным VSTi плагином. В другом случае ищи альтернативы инструментам.